Հովհաննես Իսակովը ծնվել է 1884ին Հաջիշքենդում՝ Մոսկվայում։ Իսակովի ծնողները բանվորներ էին։
Ավարտել է ռեալական դպրոցը՝ Թիֆլիսի։ 1913ին ավարտել է Պետերբուգում տեխնո ինստիտուտը։ Ծովային կորպուս է ընդունվել, բայց առաջ կար էսպիսի բան, եթե ուզում էիր ծովայինում ծառայել, պիտի ազնվական արմատներ ունենաիր։ Հովհաննեսը սովորական բանակ է մեկնում, հետո ռազմածովային տեղափոխվում։
1917ին ծառայության է անցնում Վլադիվաստոկում։ Բալթիկի նավատորմում ևս ծառայել է։ 1928ին ռազմածովայինի շտաբի տեղակալ է եղել։ 1938ին ստացել է լեյտենանտի կոչում։ Հյուսիսկովկասյան կողմը եղել է Իսակովի ղեկավարության ներքո ու հաջողել է։ Տակտիկաների մշակումը եղել է Իսակովի գերնպատակը, որը հասցրել է գիտական մակարդակի։
Նրա ռազմածովային գնահատակնները լրջագույն ուսումնասիրություններ ու ստրատեգիաներ են, որոնք մինչ այժմ անգերազանցելի են իրենց բովանդակային խորությամբ։ 1942ին Տորփեսում վիրավորվում է, ոտքը անդամահատում են։ Հովհաննեսը գրել է 100ից ավելի աշխատանքներ, որպես տեսաբան։ Ռազմածովային աշխատությունների մեջ, Իսակովը ունի անգերազանցելի աշխատություններ, որոնք ռազմածովային գործողությունների լավագույն անալիզներից են։